1. Qualità dell'aria: a causa del piccolo spazio dell'hotel a capsule, la ventilazione non è facile, il che può facilmente portare a una diminuzione della qualità dell'aria, che aumenta i rischi per la sicurezza della vita e per la salute dei passeggeri.
2. Problemi di privacy: poiché il capsule hotel è a persona, potrebbero verificarsi problemi di sicurezza e privacy.
3. Strutture e attrezzature: l'utilizzo degli hotel a capsule è molto ridotto e, per ridurre lo spazio, alcune strutture e attrezzature sono troppo semplificate e potrebbero non soddisfare le esigenze dei viaggiatori.